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主要的水稻資料庫有哪些

發布時間:2025-01-08 19:24:55

⑴ 水稻常用的lncRNA資料庫

本文詳細介紹了四個與水稻lncRNA相關的資料庫,旨在為研究者提供全面且易於使用的資源,促進水稻研究的發展。這四個資料庫分別為RNA Central、RiceLncPedia、CANATAdb 2.0和RFGB v2.0,每個資料庫針對不同需求提供特定功能和數據支持。

首先,RNA Central是一個綜合性的RNA序列和功能資料庫,旨在為RNA研究人員提供一個統一的數據資源平台。它包含多種類型的RNA序列數據,並提供比對、結構預測等工具,以及序列資料庫下載和介面,方便用戶對RNA數據進行深入研究和分析。

其次,RiceLncPedia是一個專門收集整理水稻(Oryza sativa)長鏈非編碼RNA(lncRNA)的資料庫。它提供了從多個公共資料庫和文獻報道中收集的水稻lncRNA序列和注釋信息,包括多個功能查詢和可視化工具,便於用戶快速查找和分析水稻lncRNA的相關信息。

CANATAdb 2.0是一個通過計算在36種植物和3種藻類中識別的lncRNA資料庫。它收集了36個物種中預測的239,631個長鏈非編碼RNA(lncRNA),並提供序列、表達值、基因組位置、假想多肽序列等信息,用戶可通過Blast功能找到與資料庫中相似的lncRNA。

最後,RFGB v2.0展示了國際聯合努力的水稻數據,涉及3000份來自89個國家的水稻種質。此資料庫提供了一個全球公共的水稻遺傳/基因組資料庫和信息平台,為大規模挖掘水稻重要性狀的新等位基因提供了基礎,並有望促進水稻育種技術創新。

這四個資料庫各自為研究者提供了獨特的資源和工具,涵蓋了從序列分析、功能注釋到大規模基因組數據挖掘的廣泛需求,為水稻相關研究提供了強有力的支持。

⑵ 中國歷年水稻產量去哪看

國家水稻數據中心。國家水稻數據中心是中國水稻研究所主辦的一個以水稻為主題的大型資料庫平台,會對每年的水稻產量進行統計,因此中國歷年水稻產量去國家水稻數據中心看。水稻是稻屬谷類作物,代表種為稻。

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