1. 在uniport怎麼下載氨基酸序列
找到指定轉錄本，對應的蛋白質序列。
根據基因名在NCBIGene資料庫中找到該基因，在該基因的詳細頁面中，通過ctrl和F搜索NM編號，找到NM編號對應的NP編號，點擊NP編號鏈接，轉到下載氨基酸fasta序列頁面。
2. 請教：怎麼用NCBI查詢新城疫病毒F基因的蛋白質序列、氨基酸序列和核苷酸序列呢
NCBI主頁，選gene/protein database，查newcastle F,選擇該基因直接連接到其基因網頁：
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?Db=gene&Cmd=ShowDetailView&TermToSearch=912271&ordinalpos=1&itool=EntrezSystem2.PEntrez.Gene.Gene_ResultsPanel.Gene_RVDocSum
核苷酸序列：這個基因網頁上，有一項Genomic regions, transcripts, and procts。單擊那個NC_002617.1（這個是此gene所在的染色體區域），會有兩個nucleotide選項，選擇FASTA，就連接到NCBI sequence viewer，顯示整個gene的序列。
氨基酸序列：還是這個基因網頁，底部有一個NP_071469.1， 點擊進去連接到蛋白質網頁，最下面就是氨基酸序列
蛋白質序列和氨基酸序列是一樣的吧
3. 在pdb資料庫中，怎麼查詢不到酪蛋白的氨基酸序列
你直接在PBD主頁上的pbd ID or text 里輸入你的蛋白ID，也就是1SA1和1SA0，就能查到你要的蛋白質了。蛋白ID旁邊有個Download Files，點擊後選擇你要下載的文件格式即可下載。
4. 如何在酵母資料庫中通過蛋白序列blast得到氨基酸序列
NCBI NCBI下有很多資料庫，以下是蛋白質序列
PopSet包含研究一個人群、一個種系發生或描述人群變化的一組組聯合序列。PopSet既包含核酸序列數據又包含蛋白質序列數據。
Entrez 功能強大，在於它的大多數記錄可相互鏈接，既可在同一資料庫內鏈接，也可在資料庫之間進行鏈接。當運用BLAST軟體比較某氨基酸或DNA序列與庫中其他氨基酸或DNA序列差異即進行相似性檢索時，則會涉及到蛋白質庫或核苷酸庫的庫內鏈接。庫間鏈接發生在核苷酸資料庫內的記錄與PubMed庫中已發表序列的引文間的鏈接，或蛋白質序列記錄與核苷酸序列庫中編碼它的核苷酸序列間的鏈接。
BLAST(Basic Local Alignment Search Tool）是用於序列相似性檢索的一個重要資料庫，是區分基因和基因特徵的工具。該軟體能在15秒內完成整個DNA資料庫的序列檢索。BLAST記錄的相關度有明確的統計學解釋，以便更容易地將相關記錄與隨機的資料庫記錄相區分。在NCBI主頁的左工具條中，點擊BLAST圖標，即進入BLAST主頁。
BLAST 主頁提供了幾種BLAST檢索軟體。其中BLAST2.0是一種新的BLAST檢索工具，它在原有基礎上作了改進，運行速度更快，靈敏度更高，同時具有Gapped BLAST 和PSI-BLAST兩種軟體的新功能。Gapped BLAST 允許在對準的序列中引入空位（鹼基缺失或插入），引入空位（Gaps）意味著在比較兩個相關序列時不會出現中斷（Break）現象。這些空位對準的記分系統更能反映相關序列的類似程度。PSI-BLAST的全稱是Position-Specific Iterated BALST，即特殊位置重復BLAST，它提供了自動、易用的概貌（Profile）檢索，是查找序列同源的有效工具。
Dnastar 可以用於解決你踢完的後半個問題
5. 如何在uniprot資料庫中查找某個蛋白序列
NCBI
NCBI下有很多資料庫，以下是蛋白質序列PopSet
包括研究1個人群、1個種系產生或描寫人群變化的1組組聯合序列。PopSet既包括核酸序列數據又包括蛋白質序列數據。
Entrez
功能強大，在於它的大多數記錄可相互鏈接，既可在同1資料庫內鏈接，也可在資料庫之間進行鏈接。當應用BLAST軟體比較某氨基酸或DNA序列與庫中其他氨基酸或DNA序列差異即進行類似性檢索時，則會觸及到蛋白質庫或核苷酸庫的庫內鏈接。庫間鏈接產生在核苷酸資料庫內的記錄與PubMed庫中已發表序列的引文間的鏈接，或蛋白質序列記錄與核苷酸序列庫中編碼它的核苷酸序列間的鏈接。BLAST(Basic
Local
Alignment
Search
Tool）是用於序列類似性檢索的1個重要資料庫，是辨別基因和基因特點的工具。該軟體能在15秒內完成全部DNA資料庫的序列檢索。BLAST記錄的相干度有明確的統計學解釋，以便更容易地將相干記錄與隨機的資料庫記錄像辨別。在NCBI主頁的左工具條中，點擊BLAST圖標，即進入BLAST主頁。
BLAST
主頁提供了幾種BLAST檢索軟體。其中BLAST2.0是1種新的BLAST檢索工具，它在原有基礎上作了改進，運行速度更快，靈敏度更高，同時具有Gapped
BLAST
和PSI-BLAST兩種軟體的新功能。Gapped
BLAST
允許在對準的序列中引入空位（鹼基缺失或插入），引入空位（Gaps）意味著在比較兩個相干序列時不會出現中斷（Break）現象。這些空位對準的記分系統更能反應相干序列的類似程度。PSI-BLAST的全稱是Position-Specific
Iterated
BALST，即特殊位置重復BLAST，它提供了自動、易用的概貌（Profile）檢索，是查找序列同源的有效工具。Dnastar
可以用於解決你踢完的後半個問題
6. 如何在ncbi上查找氨基酸序列
打開後在Search中選擇Nucleotide 再在下面輸入FRAT1點擊Search即可
也可輸入具體的物種名 以縮小范圍。
7. 從genebank搜索序列
確定底物特異性可以採用IP（免疫共沉澱）的方法
分子量可以跑蛋白膠
溫度和PH值對酶活性的影響，改變不同的溫度和PH值，再檢測2-鹵代酸含量
Dehx進行N端或者c端方法對氨基酸測序，從而可以得到該酶的核苷酸序列
得到序列在於資料庫以後序列對比，確定那個家族的
8. 怎麼用NCBI查詢FeSOD基因的蛋白質序列、氨基酸序列和核苷酸序列呢
直接把這個基因進行查詢，在不同的模塊下就有不同的信息：比如在Gene資料庫就會顯示geneID，染色體位置信息等。在Nucleotido中就可查到對應的核苷酸序列。其實你任意點進去一個，在仔細找裡面的鏈接也OK。
9. 在PUBMED網上能將已知的基因序列推導出其對應的氨基酸序列嗎
PUBMED不能推導出氨基酸序列，但是你可以通過很多軟體，轉化出來氨基酸序列，比如lasergene
10. 已知全基因組DNA序列，含內含子序列，請問怎麼得到相應的氨基酸序列
1、因為全基因組序列中含有內含子，所以無法直接得到mRNA序列，因此也無法推出氨基酸序列；
2、如果是一個已知基因，並且已經被人上傳到國際上的資料庫中，你可以通過文獻得到該基因的編號，這時候你可以登錄到NCBI這類資料庫中，通過該編號搜索資料庫，得到序列，同時也可以得到氨基酸序列；
3、如果需要更詳細的解決辦法，需把你背景的東西更詳細的介紹一下。希望對你有用。