⑴ 技术专栏:一篇文章搞懂晶体学信息文件CIF及其获取方法
认识与获取CIF文件
晶体学信息文件(CIF)是以“cif”为后缀的计算机文件,包含晶体结构详细信息,如晶胞参数、原子坐标与文献资料。CIF文件在晶体结构描述、解析、传播与表达中扮演重要角色,广泛应用于晶体结构绘图、XRD精修及材料理论计算。几乎所有的晶体/材料/计算处理软件,如Vesta、Diamond、GSAS、Mercury、Rasmal、Materials Studio,都将CIF文件作为输入或输出结果。因此,理解与获取CIF文件变得至关重要。
解析CIF文件内容
CIF文件可通过特定的晶体/材料学软件读取。即便是使用Windows自带的记事本或写字板打开,也能查看文件内容。文件内容主要分为六个部分:文件来源与使用信息、数据编号与文献来源、晶体结构信息、对称位置与坐标信息、原子参数信息与原子类型与价态。
获取CIF文件
CIF文件的获取是基础且重要的步骤,这个问题常由新人提出。常见获取方法包括:使用Crystallography Open Database(COD数据库)、Findit软件、The Inorganic Crystal Structure Database(ICSD)等晶体学数据库。其中,COD数据库提供免费且全面的搜索功能,通过输入元素符号与原子数量限制,即可搜索到所需CIF文件。Findit软件则需要购买或自行查找资源,通过筛选元素与搜索按钮,获取所需文件。ICSD数据库虽需购买,但拥有国际权威的无机晶体结构信息。
此外,还有PCOD数据库、The Cambridge Crystallographic Data Centre(CCDC)与International Union of Crystallography(IUcr)等其他晶体学数据库。杂志附件下载与向导师或师兄师姐索要也是获取CIF文件的有效途径。
总结,CIF文件是晶体学领域不可或缺的数据格式,正确理解其结构与获取方法对于材料科学的研究至关重要。通过上述途径,可以轻松获取与利用CIF文件,推动晶体学研究的进展。