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主要的水稻数据库有哪些

发布时间:2025-01-08 19:24:55

⑴ 水稻常用的lncRNA数据库

本文详细介绍了四个与水稻lncRNA相关的数据库,旨在为研究者提供全面且易于使用的资源,促进水稻研究的发展。这四个数据库分别为RNA Central、RiceLncPedia、CANATAdb 2.0和RFGB v2.0,每个数据库针对不同需求提供特定功能和数据支持。

首先,RNA Central是一个综合性的RNA序列和功能数据库,旨在为RNA研究人员提供一个统一的数据资源平台。它包含多种类型的RNA序列数据,并提供比对、结构预测等工具,以及序列数据库下载和接口,方便用户对RNA数据进行深入研究和分析。

其次,RiceLncPedia是一个专门收集整理水稻(Oryza sativa)长链非编码RNA(lncRNA)的数据库。它提供了从多个公共数据库和文献报道中收集的水稻lncRNA序列和注释信息,包括多个功能查询和可视化工具,便于用户快速查找和分析水稻lncRNA的相关信息。

CANATAdb 2.0是一个通过计算在36种植物和3种藻类中识别的lncRNA数据库。它收集了36个物种中预测的239,631个长链非编码RNA(lncRNA),并提供序列、表达值、基因组位置、假想多肽序列等信息,用户可通过Blast功能找到与数据库中相似的lncRNA。

最后,RFGB v2.0展示了国际联合努力的水稻数据,涉及3000份来自89个国家的水稻种质。此数据库提供了一个全球公共的水稻遗传/基因组数据库和信息平台,为大规模挖掘水稻重要性状的新等位基因提供了基础,并有望促进水稻育种技术创新。

这四个数据库各自为研究者提供了独特的资源和工具,涵盖了从序列分析、功能注释到大规模基因组数据挖掘的广泛需求,为水稻相关研究提供了强有力的支持。

⑵ 中国历年水稻产量去哪看

国家水稻数据中心。国家水稻数据中心是中国水稻研究所主办的一个以水稻为主题的大型数据库平台,会对每年的水稻产量进行统计,因此中国历年水稻产量去国家水稻数据中心看。水稻是稻属谷类作物,代表种为稻。

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