1. 在uniport怎么下载氨基酸序列
找到指定转录本，对应的蛋白质序列。
根据基因名在NCBIGene数据库中找到该基因，在该基因的详细页面中，通过ctrl和F搜索NM编号，找到NM编号对应的NP编号，点击NP编号链接，转到下载氨基酸fasta序列页面。
2. 请教：怎么用NCBI查询新城疫病毒F基因的蛋白质序列、氨基酸序列和核苷酸序列呢
NCBI主页，选gene/protein database，查newcastle F,选择该基因直接连接到其基因网页：
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?Db=gene&Cmd=ShowDetailView&TermToSearch=912271&ordinalpos=1&itool=EntrezSystem2.PEntrez.Gene.Gene_ResultsPanel.Gene_RVDocSum
核苷酸序列：这个基因网页上，有一项Genomic regions, transcripts, and procts。单击那个NC_002617.1（这个是此gene所在的染色体区域），会有两个nucleotide选项，选择FASTA，就连接到NCBI sequence viewer，显示整个gene的序列。
氨基酸序列：还是这个基因网页，底部有一个NP_071469.1， 点击进去连接到蛋白质网页，最下面就是氨基酸序列
蛋白质序列和氨基酸序列是一样的吧
3. 在pdb数据库中，怎么查询不到酪蛋白的氨基酸序列
你直接在PBD主页上的pbd ID or text 里输入你的蛋白ID，也就是1SA1和1SA0，就能查到你要的蛋白质了。蛋白ID旁边有个Download Files，点击后选择你要下载的文件格式即可下载。
4. 如何在酵母数据库中通过蛋白序列blast得到氨基酸序列
NCBI NCBI下有很多数据库，以下是蛋白质序列
PopSet包含研究一个人群、一个种系发生或描述人群变化的一组组联合序列。PopSet既包含核酸序列数据又包含蛋白质序列数据。
Entrez 功能强大，在于它的大多数记录可相互链接，既可在同一数据库内链接，也可在数据库之间进行链接。当运用BLAST软件比较某氨基酸或DNA序列与库中其他氨基酸或DNA序列差异即进行相似性检索时，则会涉及到蛋白质库或核苷酸库的库内链接。库间链接发生在核苷酸数据库内的记录与PubMed库中已发表序列的引文间的链接，或蛋白质序列记录与核苷酸序列库中编码它的核苷酸序列间的链接。
BLAST(Basic Local Alignment Search Tool）是用于序列相似性检索的一个重要数据库，是区分基因和基因特征的工具。该软件能在15秒内完成整个DNA数据库的序列检索。BLAST记录的相关度有明确的统计学解释，以便更容易地将相关记录与随机的数据库记录相区分。在NCBI主页的左工具条中，点击BLAST图标，即进入BLAST主页。
BLAST 主页提供了几种BLAST检索软件。其中BLAST2.0是一种新的BLAST检索工具，它在原有基础上作了改进，运行速度更快，灵敏度更高，同时具有Gapped BLAST 和PSI-BLAST两种软件的新功能。Gapped BLAST 允许在对准的序列中引入空位（碱基缺失或插入），引入空位（Gaps）意味着在比较两个相关序列时不会出现中断（Break）现象。这些空位对准的记分系统更能反映相关序列的类似程度。PSI-BLAST的全称是Position-Specific Iterated BALST，即特殊位置重复BLAST，它提供了自动、易用的概貌（Profile）检索，是查找序列同源的有效工具。
Dnastar 可以用于解决你踢完的后半个问题
5. 如何在uniprot数据库中查找某个蛋白序列
NCBI
NCBI下有很多数据库，以下是蛋白质序列PopSet
包括研究1个人群、1个种系产生或描写人群变化的1组组联合序列。PopSet既包括核酸序列数据又包括蛋白质序列数据。
Entrez
功能强大，在于它的大多数记录可相互链接，既可在同1数据库内链接，也可在数据库之间进行链接。当应用BLAST软件比较某氨基酸或DNA序列与库中其他氨基酸或DNA序列差异即进行类似性检索时，则会触及到蛋白质库或核苷酸库的库内链接。库间链接产生在核苷酸数据库内的记录与PubMed库中已发表序列的引文间的链接，或蛋白质序列记录与核苷酸序列库中编码它的核苷酸序列间的链接。BLAST(Basic
Local
Alignment
Search
Tool）是用于序列类似性检索的1个重要数据库，是辨别基因和基因特点的工具。该软件能在15秒内完成全部DNA数据库的序列检索。BLAST记录的相干度有明确的统计学解释，以便更容易地将相干记录与随机的数据库记录像辨别。在NCBI主页的左工具条中，点击BLAST图标，即进入BLAST主页。
BLAST
主页提供了几种BLAST检索软件。其中BLAST2.0是1种新的BLAST检索工具，它在原有基础上作了改进，运行速度更快，灵敏度更高，同时具有Gapped
BLAST
和PSI-BLAST两种软件的新功能。Gapped
BLAST
允许在对准的序列中引入空位（碱基缺失或插入），引入空位（Gaps）意味着在比较两个相干序列时不会出现中断（Break）现象。这些空位对准的记分系统更能反应相干序列的类似程度。PSI-BLAST的全称是Position-Specific
Iterated
BALST，即特殊位置重复BLAST，它提供了自动、易用的概貌（Profile）检索，是查找序列同源的有效工具。Dnastar
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6. 如何在ncbi上查找氨基酸序列
打开后在Search中选择Nucleotide 再在下面输入FRAT1点击Search即可
也可输入具体的物种名 以缩小范围。
7. 从genebank搜索序列
确定底物特异性可以采用IP（免疫共沉淀）的方法
分子量可以跑蛋白胶
温度和PH值对酶活性的影响，改变不同的温度和PH值，再检测2-卤代酸含量
Dehx进行N端或者c端方法对氨基酸测序，从而可以得到该酶的核苷酸序列
得到序列在于数据库以后序列对比，确定那个家族的
8. 怎么用NCBI查询FeSOD基因的蛋白质序列、氨基酸序列和核苷酸序列呢
直接把这个基因进行查询，在不同的模块下就有不同的信息：比如在Gene数据库就会显示geneID，染色体位置信息等。在Nucleotido中就可查到对应的核苷酸序列。其实你任意点进去一个，在仔细找里面的链接也OK。
9. 在PUBMED网上能将已知的基因序列推导出其对应的氨基酸序列吗
PUBMED不能推导出氨基酸序列，但是你可以通过很多软件，转化出来氨基酸序列，比如lasergene
10. 已知全基因组DNA序列，含内含子序列，请问怎么得到相应的氨基酸序列
1、因为全基因组序列中含有内含子，所以无法直接得到mRNA序列，因此也无法推出氨基酸序列；
2、如果是一个已知基因，并且已经被人上传到国际上的数据库中，你可以通过文献得到该基因的编号，这时候你可以登录到NCBI这类数据库中，通过该编号搜索数据库，得到序列，同时也可以得到氨基酸序列；
3、如果需要更详细的解决办法，需把你背景的东西更详细的介绍一下。希望对你有用。