atom代碼報錯

⑴ lammps報錯情況匯總

報錯代碼各有差異，但成功的代碼通常一模一樣。本文旨在記錄學習 LAMMPS 過程中遇到的各種錯誤，以及相應的解決方案。

錯誤1: Unrecognized pair style 'reaxff'

解決方法：未安裝對應的 REAXFF 包。需先安裝所需包，然後編譯，將新的可執行文件覆蓋至環境變數路徑。

錯誤2: Not a valid floating point number

解決方法：使用 processors 命令分配節點，注意調用的核數與 processors 命令指定的值相匹配。若問題由文件錯誤引起，重新核對建模文件。檢查空行、多餘行，確保 coeff 中的原子順序與 data 文件中一致。若使用 reaxff-lg 勢函數，確保 lgvdw 參數正確設置。

錯誤3: Unknown identifier in data file

解決方法：檢查 data 文件格式是否一致，確保頭數據與節數據匹配。注意數據文件中不應存在無用的空行與注釋行。

錯誤4: -nan

解決方法：檢查數據文件，Inf 通常由除零運算引起，NaN 則由非數字值或數值溢出導致。可嘗試刪除重疊原子，調整能量最小化精度，優化初始模型結構。

錯誤5: Non-numeric atom coords

解決方法：優化初始模型結構，確保原子間距合理。可採用軟力場調整力，限制能量最小化過程，或優化幾何結構以減少原子重疊。

錯誤6: Neighbor list overflow

解決方法：增加單個原子的鄰居上限，確保模擬過程內存使用合理。

錯誤7: Triclinic box skew too large

解決方法：調整模型傾斜度，或使用 box tilt large 命令取消傾斜限制。

錯誤8: Not enough space for hbonds

解決方法：減少模型原子數量或減小時間步長，確保足夠的內存分配。

錯誤9: Lost atoms

解決方法：優化模型設置，調整力場參數，或檢查初始結構。

錯誤10: Non-numeric pressure, box dimensions, positions

解決方法：檢查模型穩定性，調整初始條件、力場參數或增加內存分配。

錯誤11: Variable test: Invalid fix ID 'avee'

解決方法：在使用 fix avee 前先調用該 fix。

錯誤12: Atom IDs must be consecutive

解決方法：使用 reset_atom_ids 命令重新設置原子 ID。

錯誤13: WARNING: Shell command 'mkdir' failed

解決方法：確保文件夾名稱與當前目錄中無沖突。

⑵ atom（關於atom的基本詳情介紹）

Atom是一款專為程序員打造的跨平台文本編輯器，由GitHub提供。以下是關於Atom的基本詳情介紹：

• 界面簡潔明了：Atom以簡潔明了的圖形用戶界面著稱，為開發者提供了出色的編程體驗。

• 支持多種編程語言：Atom支持多種網頁編程語言，如CSS、HTML和JavaScript，是編寫和調試前端代碼的理想選擇。

• 高效編程功能：

  • 內置宏功能：允許用戶創建自定義的快捷鍵組合，提高編程效率。
  • 自動完成功能：幫助開發者快速編寫代碼，減少輸入錯誤。
  • 集成文件管理器：使開發者無需離開編輯器即可進行文件操作，進一步提升工作效率。

• 豐富的插件生態系統：

  • Atom允許開發者根據需求定製編輯器，以滿足特定的編程需求。
  • 無論是代碼高亮、代碼折疊，還是語法檢查和版本控制集成，Atom都能提供豐富的插件支持。

• 廣泛的適用性：無論是初學者還是經驗豐富的開發者，Atom都能提供高效、便捷的編程體驗，成為現代開發者工具箱中不可或缺的一員。