⑴ P6軟體如何如何配置手動配置下資料庫連接
在資料庫的sqlserver configuration manager 中：
1、確認資料庫服務是否開啟
2、確認TCP/IP 協議，屬性中IP 地址欄中的IP all中埠號是否設置為 1433
資料庫連接時，確認連接信息是否正確
1、如果是完整版的sql，填寫伺服器名或者IP，如果是簡裝版的sql,填寫伺服器名或IP名\SQLEXPRESS
2、確認資料庫名填寫是否正確，應為創建P6資料庫時，創建的資料庫
3、連接時，使用的用戶名是否正確。安裝P6資料庫時候，用EPPM的database和PPM的database，用戶名是不同的。可以嘗試用該用戶登陸sql server 看看能否成功。
⑵ 20160406 FASTA 與 FASTQ格式詳解
FASTA與FASTQ格式詳解
首先，FASTA格式主要用於將序列存儲到資料庫中。以UniRef資料庫中的人類血紅蛋白α亞基序列為例，序列的每一行包含了序列ID、序列簡稱、全稱、物種、基因名以及序列本身。序列中，氨基酸以單字母表示，例如P69905代表該序列在UniRef資料庫中的編號，HBA_HUMAN表示簡稱，Hemoglobin subunit alpha為全稱，OS=Homo sapiens代表物種，GN=HBA1表示基因名稱為HBA1。序列由蛋白質編碼序列組成。
對於NCBI RefSeq資料庫中的mRNA序列，每行表示資料庫中的唯一編號（gi號）、資料庫類型（如基因bank）以及序列描述。mRNA序列在描述中包含完整的編碼序列（CDS區域），並且在數據表示中使用T而不是U，以保持數據的一致性，避免混淆RNA和DNA序列。
FASTQ格式用於儲存測序數據，每條測序reads信息包括4行數據。第一行與FASTA格式類似，包含序列ID、資料庫編號以及描述信息。接下來的三行包含了序列數據和質量信息，其中質量信息是通過特定演算法計算得出的，以Phred分數表示。Phred分數是一個負對數概率值，用於量化測序錯誤的概率，通常越小表示質量越高。
Phred分數的計算方法是將測序錯誤概率（error probility，P）取對數（以10為底），然後乘以-10，得到的值即為Q值。Q值再與33或64相加，得到Phred分數，最後將Phred分數對應的ASCII字元替換鹼基，使得每個質量值都能與一個鹼基對應，提高了數據處理的效率。
不同測序平台（如Solexa和Illumina）可能使用不同的Phred值范圍，導致ASCII表略有差異。例如，Solexa平台的Phred值可能在-10至30之間，而Illumina平台的Phred值通常在0至99之間。
FASTQ格式不僅包含了序列信息，還附帶質量信息，使得測序結果更加完整和准確。未來將介紹通過FASTQ格式如何衡量測序質量，以及如何使用FastQC工具進行數據修正和分析。