⑴ P6软件如何如何配置手动配置下数据库连接
在数据库的sqlserver configuration manager 中：
1、确认数据库服务是否开启
2、确认TCP/IP 协议，属性中IP 地址栏中的IP all中端口号是否设置为 1433
数据库连接时，确认连接信息是否正确
1、如果是完整版的sql，填写服务器名或者IP，如果是简装版的sql,填写服务器名或IP名\SQLEXPRESS
2、确认数据库名填写是否正确，应为创建P6数据库时，创建的数据库
3、连接时，使用的用户名是否正确。安装P6数据库时候，用EPPM的database和PPM的database，用户名是不同的。可以尝试用该用户登陆sql server 看看能否成功。
⑵ 20160406 FASTA 与 FASTQ格式详解
FASTA与FASTQ格式详解
首先，FASTA格式主要用于将序列存储到数据库中。以UniRef数据库中的人类血红蛋白α亚基序列为例，序列的每一行包含了序列ID、序列简称、全称、物种、基因名以及序列本身。序列中，氨基酸以单字母表示，例如P69905代表该序列在UniRef数据库中的编号，HBA_HUMAN表示简称，Hemoglobin subunit alpha为全称，OS=Homo sapiens代表物种，GN=HBA1表示基因名称为HBA1。序列由蛋白质编码序列组成。
对于NCBI RefSeq数据库中的mRNA序列，每行表示数据库中的唯一编号（gi号）、数据库类型（如基因bank）以及序列描述。mRNA序列在描述中包含完整的编码序列（CDS区域），并且在数据表示中使用T而不是U，以保持数据的一致性，避免混淆RNA和DNA序列。
FASTQ格式用于储存测序数据，每条测序reads信息包括4行数据。第一行与FASTA格式类似，包含序列ID、数据库编号以及描述信息。接下来的三行包含了序列数据和质量信息，其中质量信息是通过特定算法计算得出的，以Phred分数表示。Phred分数是一个负对数概率值，用于量化测序错误的概率，通常越小表示质量越高。
Phred分数的计算方法是将测序错误概率（error probility，P）取对数（以10为底），然后乘以-10，得到的值即为Q值。Q值再与33或64相加，得到Phred分数，最后将Phred分数对应的ASCII字符替换碱基，使得每个质量值都能与一个碱基对应，提高了数据处理的效率。
不同测序平台（如Solexa和Illumina）可能使用不同的Phred值范围，导致ASCII表略有差异。例如，Solexa平台的Phred值可能在-10至30之间，而Illumina平台的Phred值通常在0至99之间。
FASTQ格式不仅包含了序列信息，还附带质量信息，使得测序结果更加完整和准确。未来将介绍通过FASTQ格式如何衡量测序质量，以及如何使用FastQC工具进行数据修正和分析。